Theo đó, mục tiêu của kế hoạch là nâng cao hiệu quả kiểm soát, xử lý ô nhiễm nước tại các lưu vực sông nêu trên. Bên cạnh đó, tăng cường trách nhiệm của các cơ quan quản lý nhà nước và các đơn vị có liên quan trong bảo vệ môi trường, khai thác, sử dụng và quản lý sông và tích hợp các kế hoạch, chương trình hành động đã được ban hành trước đây còn hiệu lực tại thời điểm hiện tại có liên quan đến các lưu vực sông.
UBND Thành phố Hà Nội xây dựng kế hoạch với 5 nhóm giải pháp để tăng cường hiệu quả công tác kiểm soát, xử lý tình trạng ô nhiễm môi trường nước.
Cụ thể, Thành phố đầu tư hạ tầng kỹ thuật môi trường,, đầu tư công trình thu gom - xử lý nước thải đô thị, làng nghề; huy động mọi nguồn lực và xây dựng hệ thống quan trắc tự động đối với các nguồn nước thải có lưu lượng xả thải lớn;
Quản lý, kiểm soát nguồn thải xây dựng cơ sở dữ liệu (CSDL) quản lý các nguồn thải ra các lưu vực sông; xây dựng và tổ chức triển khai quản lý, kiểm soát, giám sát đối với từng nguồn thải. Kiên quyết không cấp phép đầu tư, cấp giấy phép môi trường, phê duyệt báo cáo đánh giá tác động môi trường đối với các dự án, cơ sở không đảm bảo các yêu cầu về bảo vệ môi trường.
Về quản lý chất lượng nước mặt, đánh giá diễn biến chất lượng nước; rà soát mạng lưới các điểm quan trắc, bổ sung các điểm, trạm quan trắc bao gồm cả tự động, liên tục tại vị trí đặc biệt ô nhiễm;
Thanh tra, kiểm tra, xử lý vi phạm về môi trường xử lý nghiêm vi phạm xả thải. Đình chỉ hoạt động hoặc nâng cấp hệ thống xử lý nước thải nếu không đạt chuẩn.
Bên cạnh đó, Thành phố cũng yêu cầu thực hiện 14 nhiệm vụ cụ thể, trong đó tập trung các hoạt động nổi bật như: hoàn thiện danh mục nguồn thải có tác động đến chất lượng nước tại các lưu vực sông.
Tổ chức thanh tra, kiểm tra việc chấp hành pháp luật về bảo vệ môi trường đối với các cơ sở có hoạt động xả nước thải; quan trắc, đánh giá diễn biến chất lượng nước các lưu vực sông.
Ngoài ra, UBND thành phố Hà Nội yêu cầu xem xét tạm thời không cấp phép đầu tư mới hoặc cho phép mở rộng quy mô sản xuất đối với các cơ sở có nguồn thải vào sông Ngũ Huyện Khê...
